Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg2Q9QXK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Copg2Q9QXK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms