Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacl1Q9QXE0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacl1Q9QXE0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms