Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc5Q9QX29 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms