Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt17Q9QWL7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms