Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nkain4Q9JMG4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkain4Q9JMG4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms