Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc2lQ9JME7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2lQ9JME7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms