Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod4Q9JLH8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Tmod4Q9JLH8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Tmod4Q9JLH8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod4Q9JLH8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod4Q9JLH8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms