Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Tgm1Q9JLF6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Tgm1Q9JLF6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm1Q9JLF6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Tgm1Q9JLF6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tgm1Q9JLF6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tgm1Q9JLF6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Tgm1Q9JLF6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Tgm1Q9JLF6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm1Q9JLF6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm1Q9JLF6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Tgm1Q9JLF6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm1Q9JLF6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm1Q9JLF6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm1Q9JLF6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm1Q9JLF6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm1Q9JLF6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms