Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnot9Q9JKY0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms