Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl39Q9JKF7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl39Q9JKF7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms