Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4m1Q9JKC7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms