Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pard6bQ9JK83 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms