Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Alyref2Q9JJW6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Alyref2Q9JJW6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Alyref2Q9JJW6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Alyref2Q9JJW6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms