Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms