Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ascl3Q9JJR7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ascl3Q9JJR7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms