Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Efcc1Q9JJF6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Efcc1Q9JJF6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms