Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FliiQ9JJ28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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FliiQ9JJ28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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FliiQ9JJ28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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FliiQ9JJ28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FliiQ9JJ28 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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FliiQ9JJ28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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FliiQ9JJ28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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FliiQ9JJ28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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FliiQ9JJ28 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FliiQ9JJ28 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms