Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1Q9JIT0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms