Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pus3Q9JI38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms