Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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