Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf3Q9ET30 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms