Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sp6Q9ESX2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sp6Q9ESX2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms