Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST4

Psmg2, Proteasome assembly chaperone 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg2Q9EST4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg2Q9EST4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg2Q9EST4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms