Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hapln2Q9ESM3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hapln2Q9ESM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms