Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rb1cc1Q9ESK9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rb1cc1Q9ESK9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms