Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim54Q9ERP3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim54Q9ERP3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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