Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc28a3Q9ERH8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms