Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4aQ9ER60 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scn4aQ9ER60 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn4aQ9ER60 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms