Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rhox9Q9EQM5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox9Q9EQM5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms