Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r48Q9EQ52 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms