Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SyncQ9EPM5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SyncQ9EPM5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SyncQ9EPM5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SyncQ9EPM5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SyncQ9EPM5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SyncQ9EPM5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SyncQ9EPM5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms