Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl4Q9DCU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms