Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnft1Q9DCN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms