Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt112Q9DCG9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trmt112Q9DCG9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms