Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Xab2Q9DCD2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Xab2Q9DCD2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms