Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrotQ9DC50 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms