Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Smg9Q9DB90 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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