Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med27Q9DB40 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms