Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pop5Q9DB28 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms