Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnpy3Q9DAU1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnpy3Q9DAU1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms