Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms