Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms