Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhobtb1Q9DAK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms