Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1mQ9DAD9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms