Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smco2Q9DA21 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smco2Q9DA21 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smco2Q9DA21 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms