Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn34b2Q9D9N2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b2Q9D9N2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms