Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt1Q9D9J3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms