Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G3

Chic2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic2Q9D9G3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chic2Q9D9G3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chic2Q9D9G3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms