Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tvp23bQ9D8T4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms