Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl4Q9D8E6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl4Q9D8E6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.8 ms